En 2020 DeepMind presenta AlphaFold 2 en la competición CASP14 (Critical Assessment of Protein Structure Prediction), resolviendo con precisión atómica un problema abierto desde 1972: predecir la estructura tridimensional de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos. El problema del plegamiento de proteínas había resistido durante 50 años los mejores esfuerzos de la biología computacional — la brecha entre secuencia y estructura era el gran problema no resuelto de la biología molecular. AlphaFold 2 lo resuelve con una arquitectura basada en Transformers y mecanismos de atención que modelan las relaciones espaciales entre residuos de aminoácidos, combinando información evolutiva de alineamientos múltiples de secuencias con geometría estructural. El impacto es inmediato y sin precedentes: en 2022 DeepMind publica las estructuras predichas de más de 200 millones de proteínas — prácticamente todo el proteoma conocido — de forma gratuita en la AlphaFold Protein Structure Database. Acelera el descubrimiento de fármacos, la comprensión de enfermedades y la ingeniería de proteínas en décadas. Es el primer caso en que un sistema de IA resuelve un problema científico fundamental de relevancia Nobel: John Jumper y Demis Hassabis reciben el Premio Nobel de Química 2024 junto a David Baker.